Организация ресурсов проблемно-ориентированных распределенных вычислительных систем

  • № 4(10) 2017

Страницы: 

119

 – 

126

Язык: русский

Открыть файл статьи
Открыть страницу статьи в Интернет

Аннотация

Задачи химической информатики относятся к классу многозадачных вычислений и требуют построения распределенных вычислительных систем. В статье описываются типы ресурсов и способы их рациональной организации в распределенную вычислительную систему с целью сокращения времени проведения вычислительных экспериментов и минимизации времени простоя оборудования объединяемых ресурсных центров.

The Chemical informatics problems belong to the class of multitask computing and require the construction of distributed computing systems. The article describes the types of resources and their rational organizing in a distributed computer system with the aim of reducing the time of computational experiments and to minimize downtime of equipment combined resource centers.

Kimyoviy informatika masalalari ko’p masalali hisoblash sinfiga kiradi va taqsimlangan hisoblash tizimlarini qurishni talab etadi. Maqolada hisoblash ekspеrimеntlarini o’tkazish vaqtini qisqartirish va rеsurs markazlariga birlashgan bеkor ishlab turgan qurilmalarni ishlash vaqtini kamaytirish maqsadida taqsimlangan hisoblash tizimi rеsurslarining tiplari va ularni oqilona tashkil etish usullari tavsiflangan.

Список использованных источников

  1. Бекмуратов Т.Ф., Брусков В.П., Базаров Д.К., Базаров Р.К. Алгоритмы и программные средства для организации вычислительных экспериментов в распределенных вычислительных системах // Проблемы вычислительной и прикладной математики. – Ташкент, 2016. – № 4. – С. 106-115.
  2.  Виртуальная лаборатория: биохимия in silico [Электронный ресурс] / S.Yu. Yunusov; Institute of the Chemistry of Plant Substances NAS RUz. – Режим доступа: http://www.icps.org.uz/grid.html.
  3. Базаров Д.К. Система мониторинга состояния ресурсов распределенной вычислительной системы / Проблемы вычислительной и прикладной математики. - 2017, вып. 3(9) С. 117-125
  4.  Брусков В.П., Базаров Д.К., Базаров Р.К. Программный модуль визуализации промежуточных результатов молекулярного докинга. // Проблемы вычислительной и прикладной математики. – Ташкент, 2016. – № 2. – С. 101-107.
  5.  Основные классы современных параллельных компьютеров [Электронный ресурс] / Лаборатория НИВЦ МГУ. - Режим доступа: http://www.parallel.ru/computers/classes.html
  6.  Душанов Э.Б., Холмуродов Х.Т., Кутовский Н.А., Кореньков В.В., Адылова Ф.Т., Базаров Р.К., Базаров Д.К. Поиск оптимальной вычислительной системы для молекулярно-динамических расчетов. // Вопросы вычислительной и прикладной математики: Сб. Науч.тр. - Ташкент, ИМИТ АН РУз, 2010. - вып. 124. - С. 135-143.
  7.  CUDA Zone [Электронный ресурс] / NVIDIA Corporation. – Режим доступа: https://developer.nvidia.com/cuda-zone
  8.  Базаров Р.К., Базаров Д.К., Брусков В.П. Концептуальное проектирование базы данных по физикохимическим свойствам органических соединений. // Современное состояние и перспективы применения информационных технологий в управлении : материалы республиканской научно-технической конференции, 7-8 сентября 2015г. - Ташкент: Центр РПП и АПК при ТУИТ, 2015. - С.122-128.
  9.  Базаров Д.К., Брусков В.П. Разработка базы данных по физико-химическим свойствам органических соединений, Информатика: проблемы, методология, технологии: И74 сборник материалов XVI международной научно-методической конференции, 11–12 февраля 2016 г. – Воронеж: Издательство «Научно-исследовательские публикации», 2016. – С. 346-350.
  10.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, №DGU03919. Программный продукт «Скрипты резервного копирования базы данных по физико-химическим свойствам органических соединений и интерфейса пользовательского доступа на удаленные информационные ресурсы на основе rsync.» / Брусков В.П., Базаров Д.К., Абдуллаев Н.Д.; заявитель и правообладатель Институт химии растительных веществ АН РУз. - № DGU20160424; заявл. 20.07.2016; опубл. 12.08.2016. - 1 с.
  11.  Ж.И. Раззоков, Д.К. Базаров, В.П. Брусков, А.А. Фридман, Многопроцессорные кластерные расчеты методом молекулярной динамики, УФЖ, том 14, № 3, С.194-200, 2012.
  12.  Драг-дизайн: как в современном мире создаются новые лекарства [Электронный ресурс]/ Чугунов А. - Режим доступа: http://biomolecula.ru/content/15
  13. The Pickett Group [Электронный ресурс] / Warren Pickett. –Режим доступа: http://yclept.ucdavis.edu/Beowulf/notes/batchprocessingsystem.html
  14.  Р.К. Базаров, Д.Д.Ахмедов, Р.К.Джапарова, Д.К.Базаров. Распределенная вычислительная инфраструктура для науки и образования. European Researcher, 2014, Vol(76), №6-1 Режим доступа: http://www.erjournal.ru/journals_n/1403784377.pdf
  15.  V. Bruskov, R. Bazarov, D. Bazarov. Development of the grid-infrastructure for molecular docking problems, in proceeding of NEC’2011, Varna, Bulgaria, Pp.64-68.
  16.  Базаров Р.К., Базаров Д.К., Брусков В.П. Информационная система для обработки физико-химических данных органических соединений // Современное состояние и перспективы применения информационных технологий в управлении: Доклады Республиканской научно-технической конференции, Джизак, 5-6 сентября 2016 г. – Ташкент, 2016.– С. 213-219.
  17.  Базаров Р.К. Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на графических процессорах. / Проблемы вычислительной и прикладной математики. - 2017, вып. 1(7) С. 86-91
  18. Равшанов Н., Базаров Р.К., Базаров Д.К. Решение систем линейных алгебраических уравнений методом Гаусса на графических процессорах // Информационные технологии: наука, техника, технология, образование, здоровье (MicroCAD-2015): материалы XХІІІ международной научно-практической конференции, 20-22 мая 2015 г. – Харьков, 2015. – С. 241.
  19.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, № DGU04102. Программный продукт «Реализация алгоритма решения систем линейный алгебраических уравнений на графических процессорах.» / Базаров Р.К.; заявитель и правообладатель Центр разработки программных продуктов и аппаратно-программных комплексов при Ташкентском университете информационных технологий. - № DGU20160587; заявл. 28.10.2016; опубл. 09.12.2016. -1 с.
  20.  Брусков В.П. Базаров Д.К. Грид-инфраструктура с поддержкой вычислений на графических процессорах. // Информатика: проблемы, методология, технологии. Сборник материалы XVII международной научнометодической конференции, 9-10 февраля 2017 г. - Воронеж: Издательство «Научно-исследовательские публикации», 2017. - С. 190-195.
  21.  Бекмуратов Т.Ф., Мухамедиева Д.Т., Базаров Р., Ахмедов Д.Д. Параллельный муравьиный алгоритм оптимизации. Проблемы информатики и энергетики. – 2014, вып. 1-2. - С.11-15.
  22.  Базаров Р.К., Ахмедов Д.Д. Параллельный алгоритм оптимизации муравьиной колонии. // Перспективы эффективного развития информационных технологий и телекоммуникационных систем: сборник докладов республиканской научно-технической конференции. Ч. 2. Т., 2014. - С. 211-213.
  23.  Базаров Р.К. Решение задачи фолдинга белков в распределенных вычислительных грид-системах. // «Проблемы информационных и телекоммуникационных технологий»: сборник докладов републиканской научно-технической конференции. 10-11 марта 2016 г. - Ташкент, 2016. Ч.2. - С. 130-131.
  24.  Бекмуратов Т.Ф. Базаров Р.К. Базаров Д.К. Реализация муравьиного алгоритма фолдинга белков методами программных агентов в распределенных системах. / Проблемы вычислительной и прикладной математики. - 2017, вып. 2(8) С. 103-113.
  25.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, № DGU02697. Программный продукт «Параллельная версия программы, реализующей муравьиный алгоритм сворачивания белков на плоскости (ACO-HPPFP-2)» / Р.К. Базаров; - № DGU 20120260; заявл. 26.12.2012; опубл. 25.01.2013. - 1 с.
  26.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, №DGU03215. Программный продукт «Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на плоскости с помощью графических процессоров (GPU-ACO-HPPFP-2)» / БазаровР.К.; заявитель и правообладатель Центр разработки программных продуктов и аппаратно-программных комплексов при Ташкентском университете информационных технологий. - № DGU20150148; заявл. 18.05.2015; опубл. 08.07.2015. -1 с.
  27.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, №DGU04104. Программный продукт «Реализация муравьиного алгоритма для изучения фолдинга белков на плоскости методами программных агентов (AGENT-ACO-HPPFP-2) / Базаров Р.К.; заявитель и правообладатель Центр разработки программных продуктов и аппаратно-программных комплексов при Ташкентском университете информационных технологий. - № DGU20160516; заявл. 14.09.2016; опубл. 09.12.2016. -1 с.]
  28.  V. P. Bruskov, Yu.R. Mirzaev, N. D. Abdullaev, D.K. Bazarov. Molecular mechanism of muscarinic receptors inhibition by imperialine and its haloid derivatives // Proceedings of the Xth International symposium on the Chemistry of Natural Compounds. - Tashkent-Bukhara, Nov 21-23., P. 63, 2013
  29.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, № DGU03389. «Ruby on Rails вебинтерфейс доступа к базе данных по физико-химическим свойствам органических соединений». / Равшанов Н., Абдуллаев Н.Д., Брусков В.П., Базаров Р.К., Базаров Д.К.; заявитель и правообладатель Институт химии растительных веществ АН РУз. – № DGU20150372; заявл. 19.10.2015; опубл. 16.11.2015. – 1 с.
  30.  Свидетельство об официальной регистрации программы для ЭВМ, № DGU03140. «Портлет визуализации промежуточных результатов молекулярного докинга на основе Jmol» / Брусков В.П., Базаров Р.К., Базаров Д.К., Абдуллаев Н. Д.; заявитель и правообладатель Институт химии растительных веществ АН РУз. – № DGU20150372; заявл. 21.04.2015; опубл. 11.05.2015. – 1 с.

Список всех публикаций, цитирующих данную статью